О вирусе 2019-nCoV

Гомологичная рекомбинация в остроконечном гликопротеине недавно идентифицированного коронавируса может стимулировать межвидовую передачу от змеи к человеку

Нынешняя вспышка вирусной пневмонии в городе Ухань, Китай, была вызвана новым коронавирусом, обозначенным 2019-nCoV Всемирной организацией здравоохранения, который был определен путем секвенирования генома вирусной РНК. Многие пациенты потенциально подвергались воздействию диких животных на оптовом рынке морепродуктов Huanan, где также продавались домашняя птица, змеи, летучие мыши и другие сельскохозяйственные животные. 

Чтобы определить возможный резервуар вируса, мы провели всесторонний анализ и сравнение последовательностей в сочетании с относительным смещением использования синонимических кодонов (RSCU) среди разных видов животных на основе существующих последовательностей недавно идентифицированного коронавируса 2019-nCoV. Результаты, полученные в результате нашего анализа, позволяют предположить, что 2019-nCoV является рекомбинантным вирусом между коронавирусом летучей мыши и неизвестным по происхождению коронавирусом. Рекомбинация произошла в пределах вирусного всплеска гликопротеина, который распознает рецептор клеточной поверхности.

 Кроме того, наши результаты предполагают, что змея является наиболее вероятным резервуаром для диких животных для 2019-nCoV на основании ее смещения RSCU, напоминающего змею, по сравнению с другими животными. Взятые вместе, наши результаты позволяют предположить, что гомологичная рекомбинация внутри шипа гликопротеина может способствовать межвидовой передаче от змеи к человеку